La Andaluziako Juntaren eta Estatuaren arteko Aldebiko Lankidetza Batzordea paritarioa da, txandakako lehendakaritza du eta bi aldeek adostuta hartzen ditu erabakiak. Bi gobernuen arteko harreman-esparru orokor eta iraunkorra da. Funtzio nagusiak hauek dira: estatuko lege-proiektuak, politika ekonomiko orokorraren programazioa, eskumen-gatazkak, Europako politikaren jarraipena eta Estatuaren kanpo-ekintzaren jarraipena, betiere Autonomia Erkidegoaren eskumenetan edo interesetan bereziki eragiten badute.
Andaluziako Juntaren eta Estatuaren arteko Aldebiko Lankidetza Batzordeak honako Azpibatzorde iraunkor hauek sortu ditu:
Araugintzaren Jarraipenerako eta Eskumen Gatazken Prebentziorako eta Konponbiderako Azpibatzordea, bi administrazioen arteko eskumen-gatazkak prebenitzeko.
Lankidetza eta Kooperaziorako Azpibatzordea, elkarren arteko lankidetzaren arloan Estatutua garatzeko lanak bultzatzeko.
Europako Gaietarako eta Kanpo Harremanetarako Azpibatzordea, Andaluziako Juntak EBko gaietan izango duen parte-hartzea eta Estatuaren kanpo-ekintza artikulatzeko Autonomia Erkidegoaren eskumenei eragiten dieten gaietan.
Azpiegitura eta Ekipamenduen Azpibatzordea, eremu horietako interes komuneko gaiei buruz eztabaidatzeko.
La Andaluziako Juntaren eta Estatuaren arteko Aldebiko Lankidetza Batzordea sei bilera egin ditu, 2007ko apirilaren 9an, 2007ko azaroaren 12an, 2008ko irailaren 18an, 2009ko martxoaren 16an, 2011ko martxoaren 29an eta 2011ko irailaren 16an.
