Akordio horren bidez, Europako erakundeen aurrean Estatuaren borondatea osatzen parte hartzeko eskubidea aitortu zitzaien autonomia-erkidegoei (prozesuaren “goranzko fasea” deiturikoa); izan ere, ordura arte, autonomia-erkidegoek Erkidegoko Zuzenbidea betearazten baino ez zuten parte hartzen (hau da, haren “beheranzko fasea”).
2004ko abenduaren 9an, CARUEk erabaki bat hartu zuen, eta, haren bidez, behin betiko ireki zitzaien autonomia-erkidegoei beren barne-eskumenekin lotura handiena duten Europar Batasuneko Kontseiluaren lau osaeretan parte hartzeko aukera; zehazki, Ministroen Kontseilu hauetan: Enplegua, Gizarte Politika, Osasuna eta Kontsumitzaileak; Nekazaritza eta Arrantza; Ingurumena; eta Hezkuntza, Gazteria eta Kultura. Autonomia-erkidegoen ordezkaritza-sistema gauzatzeko, kide bat gehitzen zaio Espainiako Ordezkaritzari; kide horrek kontseilari-maila du, edo autonomia-gobernu bateko Kontseilu bateko kide da, eta autonomia-erkidego guztiak ordezkatzen ditu bere eskumenei eragiten dieten gaietan. Aztertu beharreko gaien inguruko konferentzia sektorialen osoko bilkurak ordezkari autonomikoa izendatzen du. Autonomia-erkidegoek proposatutako ordezkarien egonkortasuna (gutxienez seihileko bat estaliko du erkidego bakoitzak) eta ondorengotza ziurtatu beharko ditu. Izendatutako ordezkari autonomikoak bere gain hartzen du Estatuko Administrazio Orokorrarekin egindako hitzarmena, eta konpromisoa hartzen du gainerako autonomia-erkidegoen esku jartzeko gaiari buruzko dokumentazio osoa, haiei erregulartasunez informatuta egoteko negoziazioei buruz, eta jarrera bateratu bat adosteko ukitutako gainerako autonomia-erkidegoekin. Ordezkari autonomikoa Espainiako Ordezkaritzako eskubide osoko kidea da ondorio guztietarako, eta hitzaren erabilera eskatu ahal izango du eskumen autonomikoei eragiten dieten gaiak eztabaidatzen direnean eta jarrera erkide autonomikoa dagoenean.
CARUEk 2004ko abenduaren 9an onartutako akordioa hiru aldiz aldatu da ondoren: lehenengo aldaketa 2009ko uztailaren 2ko CARUEren bileran egin zen; bilera horretan, parte-hartze autonomikoa bosgarren formaziora zabaldu zen, Lehiakortasunari buruzkora; izan ere, 2004ko Akordioaz geroztik parte-hartze autonomikoa kontsumo-gaietarako bazegoen ere, praktikan gai horiek Lehiakortasunaren Kontseiluan eztabaidatzen ziren; bigarren aldaketa Hezkuntza Autonomikoaren Kontseiluan adostu zen, eta Kirolaren Kontseilu Autonomikoaren parte-hartzeari buruzko hirugarren bileran adostu zen, eta Kirolaren Kontseilu Autonomikoaren parte-hartzea eta Lanaren Kontseiluaren barruan. Azken bilera 2011ko otsailaren 15ean ere aldatu egin zen, eta CARUE ren parte-hartzea handitu egin zen. Aldaketa horiek BOEn argitaratu ziren. 2011ko abuztuaren 11koa.
Autonomia-erkidegoek parte hartzeko prozesua errazteko, 2006ko abenduaren 12an egindako CARUEren bileran Jardunbide Egokien Gida bat adostu zen. Gida horretan, autonomia-erkidegoei informazioa transmititzeko sistema zehazten da, Ministroen Kontseiluetan ordezkari autonomikoa izendatzeko irizpideak mugatzen dira, eta autonomia-erkidegoen arteko eta autonomia-erkidegoen eta Espainiako Gobernuaren arteko koordinazioa arautzen da.