Batzordea eratzeko aktan jasotzen denez, organo hori bi administrazioen arteko topagune edo topagune izango da, eta, horregatik, administrazioen arteko lankidetza-tresna ere bai, programa eta jarduera bateratuak sustatzeko sektore-eremu guztietan politika bateratuak garatzeko, bai eta prebentzio-jarduerak bideratzeko ere, bi administrazioen artean gatazkarik sor ez dadin, eta aipatutako administrazioei beren eskumeneko gaietan interesatzen zaizkien gaiak ebazteko proposamenak egiteko.
Ondorio horietarako, Batzordeak alderdi biei eragiten dieten gai guztiak aztertu ahal izango ditu, eta, bereziki, eskumenen inguruan sortutako gatazkak prozesutik kanpo konpontzeko xedea dutenak, bai eta bi administrazioen jarduerak bat egin dezakeen arloetan elkarri laguntzeko mekanismoak diseinatu ere.