A cooperación transfronteiriza recibiu en 2006 un importante respaldo da Unión Europea mediante a creación da figura xurídica das Agrupacións Europeas de Cooperación Territorial (AECT). Son reguladas polo Regulamento (CE) nº 1082/2006, do Parlamento Europeo e do Consello, do 5 de xullo.
Este Regulamento foi modificado polo Regulamento (UE) nº 1302/2013 do Parlamento Europeo e do Consello, do 17 de decembro, de modificación do anterior no que se refire á clarificación, á simplificación e á mellora da creación e o funcionamento de tales agrupacións.