El acta de constitución da Comisión concibe este órgano como foro ou punto de encontro de ambas as Administracións, e por iso, como un instrumento de colaboración entre as mesmas, co fin de buscar solucións para as necesidades de adecuación de ambas as cidades ao funcionamento do Estado autonómico, impulsar programas e posibles actuacións conxuntas para o desenvolvemento de políticas comúns nos distintos ámbitos sectoriais, e servir de canle de actuacións de carácter preventivo no intento de evitar que xurdan conflitos entre ambas as Administracións, e arbitrar propostas de solución a cuestións que interesen ás citadas Administracións en asuntos da súa competencia.