Sus funcións son as previstas nas Normas de funcionamento do 25 de novembro de 2005:

• Examinar, debatir y, en su caso, alcanzar acuerdos sobre iniciativas y asuntos que, carezcan de una instancia multilateral para su tratamiento.
• Impulsar y concretar, desde el punto de vista bilateral, aquellos instrumentos de colaboración que permitan la realización de iniciativas conjuntas de mutuo interés.
• Analizar os traspasos de funcións e servizos á Comunidade Autónoma, ben para propor solucións aos problemas expostos nos xa acordados, ben para establecer a prioridade e calendario de negociación de novos traspasos.
• Servir de cauce de actuaciones de carácter preventivo que eviten la formalización de controversias competenciales.
• Examinar y, en su caso, acordar las actuaciones que permitan resolver por vía extraprocesal conflictos positivos de competencia y recursos de inconstitucionalidad.
• Analizar as normas con rango de lei, susceptibles de dar lugar á formulación dun recurso de inconstitucionalidade, co fin de chegar a un acordo que evite a súa interposición, segundo o establecido no artigo 33.2 LOTC