As súas funcións son as previstas nas Normas de funcionamento do 25 de novembro de 2005:

• Examinar, debater e, no seu caso, alcanzar acordos sobre iniciativas e asuntos que, carezan dunha instancia multilateral para o seu tratamento.
• Impulsar e concretar, desde o punto de vista bilateral, aqueles instrumentos de colaboración que permitan a realización de iniciativas conxuntas de mutuo interese.
• Analizar os traspasos de funcións e servizos á Comunidade Autónoma, ben para propor solucións aos problemas expostos nos xa acordados, ben para establecer a prioridade e calendario de negociación de novos traspasos.
• Servir de cauce de actuaciones de carácter preventivo que eviten la formalización de controversias competenciales.
• Examinar e, no seu caso, acordar as actuacións que permitan resolver por vía extraprocesual conflitos positivos de competencia e recursos de inconstitucionalidade.
• Analizar as normas con rango de lei, susceptibles de dar lugar á formulación dun recurso de inconstitucionalidade, co fin de chegar a un acordo que evite a súa interposición, segundo o establecido no artigo 33.2 LOTC