Corresponde á Comisión de Cooperación:
- Establecer os mecanismos de información e colaboración para o exercicio das respectivas competencias.
- Colaborar na elaboración de proxectos lexislativos do Estado que afecten singularmente ás competencias e intereses de Estremadura.
- Ser canle e ámbito de resolución de conflitos entre ambas as administracións
- Cualquiera outras funcións de similar natureza expostas a iniciativa das partes.
Hasta a data non se constituíu formalmente a Comisión estatutaria, de maneira que segue vixente a Comisión Bilateral de Cooperación Administración do Estado – Comunidade Autónoma de Estremadura de 11. FEB.1992, e o regulamento interno adoptado na reunión da Comisión Bilateral de 13.ABR.2005.
Está composta por cinco membros permanentes designados por cada unha das representacións e ademais poderán asistir outros representantes en función dos temas a tratar. A presidencia da Comisión corresponde á Administración do Estado e a Vicepresidencia á Comunidade Autónoma. Cada representación estará asistida por un secretario.