La AGET é a encargada de exercer a actividade do Estado de forma desconcentrada no territorio, correspondendo ao Delegado do Goberno a dirección da mesma no ámbito autonómico e a súa coordinación coa Administración da Comunidade Autónoma.
A Lei 40/2015, do 1 de outubro, fixa unha estrutura da Administración Xeral do Estado no Territorio que prevé a integración de servizos periféricos ministeriais nas Delegaciones e Subdelegacións do Goberno e Direcciones Insulares, así como a consecuente supresión dos órganos cuxos servizos se integren.
No obstante, prevese a non integración de servizos por singularidades das súas funcións ou polo volume de xestión.
A Administración Xeral do Estado no Territorio ten un valor esencial e insubstituíble en termos de eficacia, información e representación do Estado no territorio.