La cooperació transfronterera va rebre en 2006 un important suport de la Unió Europea mitjançant la creació de la figura jurídica de les Agrupacions Europees de Cooperació Territorial (AECT). Són regulades pel Reglament (CE) núm. 1082/2006, del Parlament Europeu i del Consell, de 5 de juliol.
Este Reglament ha sigut modificat pel Reglament (UE) núm. 1302/2013 del Parlament Europeu i del Consell, de 17 de desembre, de modificació de l'anterior pel que fa a la clarificació, a la simplificació i a la millora de la creació i el funcionament de tals agrupacions.
