Corresponde a la Comissió de Cooperació:
- Establir els mecanismes d'informació i col·laboració per a l'exercici de les respectives competències.
- Colaborar en l'elaboració de projectes legislatius de l'Estat que afectin singularment de les competències i interessos d'Extremadura.
- Ser llit i àmbit de resolució de conflictes entre totes dues administracions
- Cualquiera otras funciones de similar naturaleza planteadas a iniciativa de las partes.
Hasta la data no s'ha constituït formalment la Comissió estatutària, de manera que continua vigent la Comissió Bilateral de Cooperació Administració de l'Estat – Comunitat Autònoma d'Extremadura de 11. FEB.1992, i el reglament intern adoptat en la reunió de la Comissió Bilateral de 13.ABR.2005.
Está composta per cinc membres permanents designats per cadascuna de les representacions i a més podran assistir altres representants en funció dels temes a tractar. La presidència de la Comissió correspon a l'Administració de l'Estat i la Vicepresidència a la Comunitat Autònoma. Cada representació estarà assistida per un secretari.