La AGET és l'encarregada d'exercir l'activitat de l'Estat de forma desconcentrada en el territori, corresponent al Delegado del Govern la direcció de la mateixa en l'àmbit autonòmic i la seva coordinació amb l'Administració de la Comunitat Autònoma.
La Llei 40/2015, d'1 d'octubre, fixa una estructura de l'Administració General de l'Estat en el Territori que preveu la integració de serveis perifèrics ministerials en les Delegaciones i Subdelegacions del Govern i Direcciones Insulares, així com la consegüent supressió dels òrgans els serveis dels quals s'integrin.
No obstante, es preveu la no integració de serveis per singularitats de les seves funcions o pel volum de gestió.
L'Administració General de l'Estat en el Territori té un valor essencial i insubstituïble en termes d'eficàcia, informació i representació de l'Estat en el territori.