La Secretaria General Tècnica s'estructura en les següents subdireccions generals:
- La Sotssecretaria General Tècnica: Álvaro Cañoto Getino
- La Subdirección General de Informes sobre Asuntos de Política Territorial: Sofía Serrano Martín
- La Subdirecció General de Recursos, Publicacions i Documentació: Mª Belén España Martí