Les seues funcions són les previstes en les normes de funcionament aprovades el 21 de febrer de 2019:

• Impulsar la realització d'actuacions i plans conjunts per al desenvolupament de les polítiques comunes i, en el seu cas, subscriure els oportuns convenis de col·laboració.
• Dissenyar mecanismes de col·laboració mútua en les diferents àrees en què puga confluir l'activitat de totes dues administracions.
• Servir d'instrument per a previndre conflictes entre totes dues administracions.
• Arbitrar propostes de solució a qüestions que interessen a totes dues parts en assumptes de la seua competència.
• Examinar qualssevol assumptes que afecten de totes dues parts i en particular, els que tinguen per objecte evitar o intentar resoldre per via extraprocessal conflictes de competència.