Per Ordre TMD/1217/2024, de 29 d'octubre, es publica el nou Reglament Intern de Funcionament de la Comissió Bilateral de Cooperació (BOE Núm. 267, de 5 de novembre de 2024), acordat en la reunió de 28 d'octubre de 2024. El mateix, va entrar en vigor l'endemà de la seua publicació en el BOE. En el marc previst en el seu Reglament Intern de Funcionament, la Comissió Bilateral exercirà funcions de consulta i adopció d'acords que tinguen per objecte la millora de la coordinació entre les respectives Administracions en assumptes que afecten de manera singular a la Comunitat Autònoma del País Basc, i en particular:
a) Les controvèrsies de qualsevol índole plantejades entre les dues parts i la proposta, si escau, de mesures per a resoldre-les i, si escau, per a l'aplicació i interpretació de l'Estatut d'Autonomia, sense perjudici de la jurisdicció pròpia del Tribunal Constitucional i dels Tribunals de Justícia.
b) L'anàlisi i impuls dels traspassos de funcions i serveis a la Comunitat Autònoma, podent establir una prioritat i calendari de negociació de nous traspassos.
c) El seguiment de la política europea per a garantir l'efectivitat de la participació de la Comunitat Autònoma del País Basc en els assumptes de la Unió Europea, en particular en la formació de la posició de l'Estat en relació amb el disseny i aplicació de les polítiques comunes comunitàries i de les normes amb incidència directa en el règim econòmic i fiscal de la Comunitat Autònoma.
d) La participació, informació, col·laboració i coordinació en l'exercici de les seues respectives competències.