Des de la seua creació en 2004, la Conferència de Presidents ha celebrat vint-i-set reunions, amb els següents ordres del dia:
Conferència de Presidents
I Conferencia de Presidentes. 28 de octubre de 2004
- Institucionalització de la Conferència
- Desenvolupament de la participació de les CCAA en els Assumptes Comunitaris Europeus
- Anàlisis del finançament de l'assistència sanitària.
II Conferència de Presidents. 10 de setembre de 2005
- Finançament sanitari: Acord Estat-Comunitats Autònomes. L'aportació total del Govern es va fixar inicialment en 3.042,4 milions d'euros per a 2006 i en 3.142,4 milions d'euros per a 2007.
III Conferència de Presidents. 11 de gener de 2007
- Investigación, Desarrollo Tecnológico e Innovación (I+D+i): Adopción de un Documento conjunto.
- Acord per a la creació de les Conferències Sectorials de l'Aigua i d'Immigració.
- Creació d'un Grup de Treball per a l'Elaboració del Reglament de la Conferència de Presidents.
IV Conferència de Presidents. 14 de desembre de 2009
- Aprobación del Reglamento de la Conferencia de Presidentes (DEROGADO)
- Presidència Espanyola del Consell de la Unió Europea, per a 2010, donant suport a les prioritats definides per a la Presidència. Declaració.
- Violència de Gènere i necessitat d'impulsar els instruments per a lluitar contra ella. Declaració.
- Debat General sobre Ocupació, Economia sostenible, i Agricultura, Ramaderia, Pesca i Política Hidràulica.
V Conferencia de Presidentes. 2 de octubre de 2012
- Estabilitat Fiscal, Situació Econòmica i laboral d'Espanya. Declaració final.
VI Conferència de Presidents. 17 de gener de 2017